Identification des biomarqueurs des maladies du foie dans l’immunodéficience variable commune

La maladie du foie est une complication grave sous-diagnostiquée qui met en péril la survie des patients atteints d’un déficit immunitaire commun variable (DICV). BIOLIV examinera comment les facteurs microbiens et hôtes circulants varient selon le degré de gravité des lésions hépatiques dans le DICV. Cette concentration est essentielle étant donné que la translocation de l’ADN microbien le long de l’axe intestin-foie alimente le développement d’anomalies cellulaires hépatiques. L’objectif de ce projet est 1) de stratifier les patients DICV en fonction des changements dans les signatures microbiennes et hôtes en circulation et 2) de développer un modèle de prédiction dynamique de la progression de la maladie hépatique. Ce projet rassemble une équipe académique et une équipe clinique possédant des compétences complémentaires en médecine, immunologie, microbiologie et biologie computationnelle. BIOLIV exploite les éléments suivants des équipes : 1) l’accès à la base de données et à une collection de plusieurs décennies de spécimens de biobanques permettant une analyse longitudinale approfondie des facteurs épigénétiques microbiens et de l’hôte, 2) des compétences dans des cadres analytiques avancés pour traiter de manière exhaustive plusieurs types d’ensembles de données omiques performants. grandes approches de biologie systémique 3) expérience dans la découverte d’une interférence conjointe entre les facteurs circulants microbiens et hôtes dans la biologie sous-jacente et sa traduction en biomarqueurs prédictifs et diagnostiques. Ce projet est composé de quatre Work Packages (WP) interconnectés. Le WP1 se concentre sur l’élucidation de la relation entre l’ADN microbien circulant dans le sang et les maladies hépatiques. Le WP2 se concentre sur l’utilisation d’un ADN acellulaire circulant (cfDNA) pour détecter les complications hépatiques en invoquant la principale caractéristique pathologique des lésions hépatiques (c’est-à-dire la mort des cellules hépatocytaires dans la circulation sanguine). WP3 effectue une analyse protéomique, une analyse des protéines immunitaires et pro-inflammatoires associées aux phénotypes cliniques. Le WP4 effectuera une analyse intégrée des données sur les facteurs circulants microbiens et de l’hôte pour identifier les marqueurs prédictifs et les signatures de la maladie du foie. Nous nous sommes particulièrement intéressés aux premiers biomarqueurs avant que des lésions hépatiques irréversibles ne surviennent. Les biomarqueurs prédictifs identifiés et les signatures de la maladie du foie seront évalués dans une cohorte de validation analytiquement indépendante.